Un état de déficience de l'hormone de la thyroïde présente à la naissance. Environ 1 4000 chez le nouveau-né a une déficience grave de la fonction thyroïdienne, tandis que plus encore ont des degrés douces ou partielles. Si non traitée pendant plusieurs mois après la naissance, l'hypothyroïdie congénitale peut conduire à la déficience intellectuelle comme permanent de retard mental et une croissance anormale. Dans les Etats-Unis et beaucoup d'autres pays, tous les nouveau-nés sont testés pour hypothyroïdie congénitale. Si le traitement commence dans le mois suivant la naissance, les bébés généralement se développent normalement.

Traitement habituellement se compose d'une dose quotidienne d'hormone thyroïdienne (thyroxine) par voie orale. Parce que le traitement est simple, efficace et peu coûteux, presque toutes les pratiques du monde développé nouveau-né de dépistage pour détecter et traiter l'hypothyroïdie congénitale dans les premières semaines de vie.