Peinture chromosomique dans son sens original (comme appliqué aux humains et autres animaux) est défini comme l'utilisation de sondes marquées fluorescence, spécifiques des chromosomes pour visualiser des chromosomes entiers ou régions chromosomiques à grande échelle. Ces sondes sont obtenus à partir des chromosomes ou de segments de chromosomes isolé soit par débit tri (séparation des chromosomes en suspension sur la base de leur fluorescence relative à l'aide d'un cytomètre de flux/trieur) ou l'isolement de la microdissection d'acide désoxyribonucléique (ADN) d'un type particulier de chromosomes ou de sa part à l'aide d'une pipette microcapillaire fine. Sondes l'ADN isolé sont amplifiés par la réaction en chaîne de polymérase (PCR), fluorescent marqués et visualisés sur des préparations chromosomiques sur une lame microscopique. De cette technique est communément connu comme la fluorescence in situ hybridization (FISH) et il se réfère à la cartographie physique de la recombinaison (hybridation) de fluorescence marqué ADN ou acide ribonucléique (ARN) des sondes avec des séquences nucléotidiques complémentaires dans les chromosomes ou les noyaux.