Une technique de séparation d'un flux de gros ions accélérés dans un champ magnétique. La résistance à la déflexion de l'ion de son chemin d'accès est une mesure de la dynamique de l'ion et donc de sa masse. Dans les premières versions, le matériau de l'échantillon a été volatilisé par la chaleur et ionisé par un faisceau d'électrons. Techniques de plus tard de mettre l'échantillon hors de sa phase liquide ou solide, c'est-à-dire de désorption et d'ionisation de celui-ci, sont bombardement d'atomes rapides MS (FA-MS) par un faisceau d'ions et de la désorption MS (PD-MS) de plasma par irradiation de nucléides fille de 252Cf désintégration. Dans le champ et la désorption MS (FD-MS) l'échantillon est tout d'abord ionisé et puis s'est volatilisé, un processus qui induit un stress beaucoup moins thermique sur l'échantillon à champ-ionisation MS, dans laquelle l'échantillon est tout d'abord s'est volatilisé et puis ionisé dans un champ électrostatique. Dans la désorption laser-aidé MS (LD-MS) et la désorption-ionisation de laser assistée par matrice (MALDI-MS) l'échantillon de MS les échanges d'énergie avec une matrice solide ou liquide afin de minimiser les dommages à l'échantillon et d'isoler une molécule d'échantillon des autres. Dans l'ionisation par électronébulisation MS (ES-MS), atomisation des particules de la solution d'ions de protéines dont le solvant s'évapore à vacuo feuilles multiplient protéine ions chargés.